Silenciamiento mediado por CRISPR-Cas9 de CD44 en células humanas de osteosarcoma altamente metastásico


Tipo: Las líneas celulares de osteosarcoma MNNG/HOS y 143B utilizadas en este estudio se adquirieron de ATCC

Dirigido hacia:  La línea celular MNNG/HOS se transformó con N-metil-N'-nitro-N-nitrosoguanidina (MNNG), mientras que la línea celular 143B se transformó con Ki-ras

Dirigido por:  La guía U6gRNA-Cas9±2A-GFP del vector de expresión de proteína de fusión CRISPR-Cas9 y proteína verde fluorescente (GFP) por CD44 sgRNA (abreviado como CD44- Cas9-GFP)

Órgano o célula a tratar:  El grupo de diferenciación 44 (CD44) es un receptor para el ácido hialurónico (HA), y se ha demostrado que el CD44 unido a HA participa en diversas actividades tumorales biológicas, incluida la progresión tumoral, la metástasis y la quimio resistencia.

Vía de administración: Parenteral

Resultados: 

Para evaluar si CRISPR/Cas9 en conjunto con sgRNA de CD44 podía eliminar CD44, se realizó una transferencia Western. El ensayo demostró que la expresión de la proteína CD44 se inhibió significativamente en células MNNG/HOS transfectadas con CD44- Cas9-GFP. La expresión de CD44 de MNNG/HOS fue reprimida.

La eliminación de CD44 por CRISPR-Cas9 suprimió la actividad de migración e invasión de las células del osteosarcoma. La migración y la invasión son requisitos previos cruciales para la metástasis del osteosarcoma. La cicatrización de heridas mostró una inhibición sustancial cuando las células se transfectaron con CD44-Cas9-GFP.

Bibliografía:

  1. Liu, T., Yan, Z., Liu, Y., Choy, E., Hornicek, F. J., Mankin, H. y Duan, Z. (2018). Silenciamiento mediado por CRISPR-Cas9 de CD44 en células humanas de osteosarcoma altamente metastásico. Fisiología celular y bioquímica: revista internacional de fisiología celular experimental, bioquímica y farmacología, 46(3), 1218–1230. https://doi.org/10.1159/000489072


Efectos de las células madre cardíacas en el sustrato arritmogénico postinfarto


Tipo de Célula:  células madre, específicamente las células derivadas de la cardiosfera (CDC)

Método de obtención: Los CDC se obtuvieron de explantes de tejido cardíaco de cerdos blancos grandes sacrificados.  El tejido se sometió a tres digestiones enzimáticas sucesivas con una solución de tripsina al 0,2% y colagenasa IV al 0,2% a 37 °C durante 5 min cada una. El tejido digerido se lavó y se cultivó con medio de explante completo a 37 °C y 5% de CO2.

Vía de administración: vías de administración de CDC en la remodelación ventricular izquierda compara las propiedades histológicas y electrofisiológicas de la cicatriz densa y el tejido heterogéneo entre un grupo de control y un grupo que recibió CDC por vía intracoronaria e intramiocárdica

Resultados: 

  1. Los volúmenes ventriculares izquierdos y la fracción de eyección no fueron diferentes entre los grupos a las 4-16 semanas
  2. Este estudio mostró que los CDC no eliminaron las cicatrices preexistentes, sino que modificaron la histología de la cicatriz densa, y la TH modificó el mecanismo de expansión de la cicatriz como lo sugiere la relación de los volúmenes de cicatrices densas entre las semanas 4 y 16.
  3. Los CDC podrían retrasar el crecimiento de la cicatriz al bloquear la infiltración del tejido circundante por una cicatriz densa. En este sentido, la movilización de células madre en la zona del infarto puede proteger y prevenir el avance del deterioro tisular

Referencia

Modelos animales experimentales de disfunción microvascular coronaria



La mayoría de pacientes con trastornos metabólicos presentan una disfunción microvascular coronaria (CMD), la que contribuye a desarrollar isquemia miocárdica con presencia o ausencia de arterioesclerosis coronaria epicárdica. Debido a la relación ha sido necesario el uso de animales transgénicos que fueron utilizados para estudiar los efectos de diferentes factores de riesgo en el desarrollo y progresión de la CMD, estos modelos animales proporcionan información importante sobre la base genética y ambiental de la fisiopatología coronaria humana en la cardiopatía isquémica (1).

Transgénicos.
Ventajas
  1. Crecimiento acelerado del producto, conociendo la fisiología de los organismo se pueden alterar genes involucrados en los mecanismos de crecimiento, acelerando el desarrollo de animales o plantas.
  2. Aumenta la producción de los cultivos agrícolas modificando las plantas para otorgarles mas resistencia a los herbicidas de forma que se puedan eliminar las plantas que compiten por el agua.
  3. Los alimentos transgénicos son menos propensos a ser atacados por virus, hongos o bacterias.
  4. Es posible modificar alimentos para que produzcan ciertas vitaminas que satisfagan las deficiencias nutricionales.
  5. Reducen el impacta a la agricultura dado que estos alimentos son más resistentes a las plagas hace que sea menos necesario usar químicos.
Desventajas
  1. Dadas la características de los animales genéticamente modificados poseen ventajas sobre las especies nativas.
  2. El exceso de regulaciones hace que la mayoría de instituciones públicas no se vea interesado en la producción de alimentos transgénicos lo que dificulta el acceso a ellos
  3. Su gran resistencia producto de su modificación podría causar alergias u otras problemas de salud.
  4. Los protocolos de seguridad para los alimentos modificados dependen de cada país lo que dificulta la comercialización de estos alimentos.
  5. El uso de herbicidas más fuertes que no dañan alimento transgénico pero si a la fauna silvestre.

Referencias:

Mycobacterium tuberculosis PE_PGRS41 mejora la supervivencia intracelular de M. smegmatis dentro de los macrófagos mediante el bloqueo de la inmunidad innata y la inhibición de la defensa del huésped


Un ejemplo de un microorganismo con cierta capacidad recombinante es el Mycobacterium semegmatis, dado que su  la capacidad de patogénica fue muy evidente, por lo que mediante este experimento se utilizó al Mycobacterium tuberculosis que produce PE_PGRS41 que al estar en contacto con la M. semegmatis provoco que esta se volviera patógena, haciendo que todos los macrófagos infectados bajara la producción de TNF-α, IL-1β e IL-6, además de que todos los macrofagos infectados con M.S. presentaron una mayor muerte celular por apoptosis celular y autofagia. Se concluyó que PE_PGRS41 es suficiente para dar capacidades patogénicas a M.S. (1).


Tema: Ingeniería del SARS-CoV-2 utilizando un sistema genético inverso.
Objetivo: El sistema genético inverso se puede utilizar para diseñar rápidamente virus con las mutaciones deseadas para estudiar el virus in vitro e in vivo.
Gen a clonar: ADNc infeccioso (icSARS-CoV-2).
Enzimas de restricción: BsaI-HFv2, Esp3I,Esp3I, SnaBI.
Enzima ligasa: ADN ligasa T4 y de tampón de ligadura.
Vector: Plásmido derivados del Vector pUC57, Vector pCC1.
Célula receptora: Células Vero B6, BHK-21.
Mecanismo de trasferencia: Conjugación bacteriana.
Método de identificación de clones: Electroforesis (BIO-RAD), RT-PCR, cultivo de bacterias (Fisher scientific), secuenciación, amplificación (2)

Referencias:


Importancia pronóstica y clínico-patológica de la expresión de microRNA-140 en pacientes con cáncer: un metaanálisis


 

En este metaanálisis se investiga al Micro RNA-140 y su importancia como biomarcador para el pronóstico del cáncer, este miRNAs es de los más prometedores dado que nos da información sobre las característica clínico patológicas y el pronóstico del paciente a futuro por su correlación con el índice de supervivencia general de los pacientes con  pronóstico de cáncer.

En cuanto a la búsqueda de información se utilizó odds ratios (OR) o cocientes de riesgos instantáneos (CRI) con intervalos de confianza (IC) del 95% para delinear la correlación entre los niveles de miR-140 y el pronóstico del paciente con cáncer.

Se realizo un análisis combinado de 12 artículos que  fueron elegibles los cuales en conjunto cubren a 1386 pacientes desde el 2013-2020 dándonos los siguientes resultados.

  1. Una expresión elevado del miR-140 se relacionó con un alto índice de supervivencia general al cáncer tanto en grupos en los que se realizaron intervenciones quirúrgicas como en los que no.
  2. También niveles elevados de miR-140 hubo un mejor pronostico en pacientes con cáncer del sistema digestivo, cabeza y cuello, siendo las más importantes.
  3. Entre otros pero siendo estas los más destacables.

Por ultimo con este metaanálisis se concluyó que una baja expresión del miR-140 está relacionada con un menor índice de supervivencia general, un estadio TNM (Tumor-Nódulo-Metástasis) más avanzado con, un peor grado histológico y positivo para metástasis ganglionar. Por lo que el miR-140 es muy prometedor no solo como biomarcador de cáncer sino como posible tratamiento para el mismo.

Referencia:


Enfoques y desarrollos actuales en el perfil de transcripción de la placenta humana.



Este artículo busca información relevante para el diagnóstico previo de enfermedades, partiendo de todo el genoma del transcriptoma placentario. se utilizaron varias técnicas y entre ellas la de Microarrays con el objetivo de buscar factores patológicos que puedan ayudar en el diagnóstico de mujeres embarazadas para saber si pueden desarrollar Preeclamsia.

En el estudio participaron mujeres con y sin Preeclamsia, en el que se utilizó el microarray  Affymetrix U95A el cual permitió encontrar el ARNm soluble de tirosina quinasa 1 (sFlt1) el cual podría ser utilizado como un valor predictivo en mujeres con sospecha de preeclamsia (2).

Además a también hacen recencia a la relación entre  sFlt-1: PlGF como valores predictivos en pacientes con sospecha clínica de preeclamsia (3). 

Bibliografia:

  1. Hannah E J Yong, Shiao-Yng Chan, Enfoques actuales y desarrollos en el perfil de transcripción de la placenta humana, Actualización de reproducción humana, Volumen 26, Número 6, noviembre-diciembre de 2020, páginas 799-840, https://doi.org/10.1093/humupd/dmaa028
  2. Maynard SE, Min JY, Merchan J, Lim KH, Li J, Mondal S, Libermann TA, Morgan JP, Sellke FW, Stillman IE, Epstein FH, Sukhatme VP, Karumanchi SA. El exceso de tirosina quinasa 1 similar al FMS soluble placentario (sFlt1) puede contribuir a la disfunción endotelial, la hipertensión y la proteinuria en la preeclampsia. J Clin Invest. 2003 Marzo;111(5):649-58. doi: 10.1172/JCI17189. PMID: 12618519; PMCID: PMC151901.
  3. Zeisler H, Llurba E, Chantraine F, Vatish M, Staff AC, Sennström M, Olovsson M, Brennecke SP, Stepan H, Allegranza D, Dilba P, Schoedl M, Hund M, Verlohren S. Valor predictivo de la relación sFlt-1: PlGF en mujeres con sospecha de preeclampsia. 2016 Enero 7;374(1):13-22. doi: 10.1056/NEJMoa1414838. PMID: 26735990.

La alta expresión de ARN largo no codificante MALAT1 en el cáncer de mama se asocia con una supervivencia deficiente sin recaída

Objetivo: Estudiar la transcripción del Metastasis- Associated Lung Adenocarcinoma Transcrip 1 (MALAT1) asociado al cáncer de pulmón en las células no pequeñas del pulmón, relacionando la expresión del mismo gen MALAT1 en pacientes que sobreviven y desarrollan cáncer de mama.

Muestra: Muestras tumorales de 509 pacientes durante la resección quirúrgica de su cáncer primario. 

Tipo de Ácido Nucleico: ARN largo no codificante (lncARNs)

Genes a analizar: La localización subcelular también determina la función de lncRNA que rodean el nucleo y regulan la exprecion genica de X Inactive Specific Transcrip (XIST), BMP2- OP1- Responsive Gene (BORG) y Nuclear Enriched Aboundant Transcrip 1 (NEAT1).

MALAT1 también es conocida como Nuclear-Enriched Abundant Transcrip 2 (NEAT2) localizad en chr11q13 con 8.0 kb de longitud.

Tipo de PCR: Reaccion en cadena cuantitativa de la polimerasa con transcriptasa inversa (qRT-PCR)

Pasos:

  1. El ARN total se extrajo de muestras frescas de tumores de mama congelados (~ 30 mg) utilizando el kit de ADN/ARN de Allprep (Qiagen)

  2. Alrededor de 1 μg de ARN total se transcribió inversamente en ADNc utilizando el kit de transcripción inversa de LifeTech.
  3. El ADNc se amplificó para una región específica de MALAT1 después de mezclarse con el SYBR Green Master Mix (LifeTech) y un par de cebadores específicos para MALAT1. 
  4. Se utilizó GAPDH como referencia. 
  5. Los cebadores de PCR fueron diseñados utilizando la secuencia NR_002819.2 y sintetizados por Integrated DNA Technologies. 
  6. Los niveles de expresión de MALAT1 se calcularon como un Indice de Expresión (EI) utilizando la fórmula 1.000 × 2(−ΔCt), donde ΔCt = Ct (MALAT1) − Ct (GAPDH). Cada muestra fue analizada por triplicado. Se repitieron las pruebas con réplicas deficientes (coeficiente de variación >15%).


Referencia 

Wang, Z., Katsaros, D., Biglia, N., Shen, Y., Fu, Y., Loo, L. W. M., Jia, W., Obata, Y. y Yu, H. (2018). La alta expresión de ARN largo no codificante MALAT1 en el cáncer de mama se asocia con una supervivencia deficiente sin recaídas. Investigación y tratamiento del cáncer de mama, 171(2), 261–271. https://doi.org/10.1007/s10549-018-4839-2

El papel de los microARN en la modulación de la infección por SARS-CoV-2 en células humanas: una revisión sistemática



En este metaanálisis hablaremos de la importancia de los micro ARN (miARN) que se han convertido en uno de los biomarcadores más relevantes en el diagnostico de enfermedades. Estas moléculas de miARN desempeñan un papel en la regulación de la expresión génica de varios organismo y su proceso de traducción o al causar degradación de los ARNm objetivo.

Aunque los mecanismo de interacción entre los virus y miARN no se conocen completamente pueden interferir en la replicación de células huésped.

Este estudio se centró en describir los roles, funciones o alteraciones de miRNA en la mediación de la infección por SARS-CoV-2 en las células humanas.


Referencias bibliografica:

La ingesta de carbohidratos y grasas asociada con el riesgo de enfermedades metabólicas a través de la epigenética de CPT1A

 


En este estudio epigenético se identificó que el sitio de metilación del ADN cg00574958 el gen de la carnitina palmitoiltransferasa-1 A (CPT1A) está asociado con un menor riesgo de enfermedades metabólicas.

Para este estudio se examinó la ingesta de carbohidratos (CHO) y grasas (FAT) y su relación con el gen CPT1A Y – cg00574958 para esto se realizó un metaanálisis donde se estudió la transcripción del CPT1A y también la mediación con la ingesta de CHO Y FAT con la mediación de cg00574958 como mediador.

Este estudio dio como resultado que además de la expresión de ARNm de CAPT1A se asoció negativamente a la ingesta de CHO y positivamente a la ingesta de FAT y los fenotipos metabólicos, lo que apoya la hipótesis de que la ingesta de CHO induce a la metilación de CPT1A reduciendo así el riesgo de enfermedades metabólicas.

Referencia bibliográfica.

La interacción ACE2/ADAM17/TMPRSS2 puede ser el principal factor de riesgo para COVID-19




En este artículo de Revisión se presentan los conceptos fisiopatológicos que se relacionan entre ACE2/ADAM17/TMPRSS2 en los principales trastornos clínicos informados con pacientes con COVID-19. 

Dentro de las muchas interacciones fisiopatológicas presentadas en este articulo resumiré la que a mi parecer es la más interesante como la importancia de la relación entre le COVID-19 Y ACE2.

El ACE2 es una enzima reguladora del Sistema Renina Angiotensina que participa en la protección contra las lesiones cardiovascular y pulmonar aguada, por otro lado desempeña un papel como importante receptor del SARS-CoV-2 facilitando su entrada a la célula. Después de la interacción con la proteína de pico de superficie (S) viral, ACE2 se internaliza junto con partículas virales y endosomas reduciendo la expresión tisular de ACE2. Además después de la infección por SARS-CoV de los tejidos miocárdicos y pulmonares la expresión del ARNm de ACE2 también se inhibió. 

Referencia bibliográfica: